東莞市醫(yī)療器械行業(yè)協(xié)會
DongguanAssociation of Medical Devices
工作日8:30-17:30
0769-28820188/28822216
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Xenium單細(xì)胞分辨率
賦能腫瘤空間組學(xué)研究
上海蘭衛(wèi)醫(yī)學(xué)檢驗所股份有限公司（以下簡稱“蘭衛(wèi)醫(yī)學(xué)”）秉承科研創(chuàng)新和勇于爭先的精神，與10x Genomics公司合作建立了高水平示范實驗室，配置了先進(jìn)的科研設(shè)備，為臨床科研提供單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序、空間轉(zhuǎn)錄組測序（Visium平臺）和基于原位雜交技術(shù)的空間轉(zhuǎn)錄組（Xenium平臺）檢測服務(wù)。
2024年1月16日，Xenium技術(shù)平臺第一批實驗樣本檢測數(shù)據(jù)正式下機，質(zhì)控完全合格，在上海率先高質(zhì)量高效率完成交付檢測和數(shù)據(jù)分析。該項目基于研究者對“腫瘤-分子病理-單細(xì)胞/亞細(xì)胞分辨率空間組學(xué)”層層遞進(jìn)的研究構(gòu)思，確定各種類型細(xì)胞的空間定位、比例和分布特征，逐步將target bio-marker定位在單細(xì)胞，為佐證研究者的idea提供了高水準(zhǔn)、信息化和可視化的結(jié)果與證據(jù)。
圖1：腫瘤病理標(biāo)注
圖2：Xenium數(shù)據(jù)概覽
圖3：Xenium將光學(xué)特征解碼為轉(zhuǎn)錄本表達(dá)，采集并形成圖像
圖4-1：利用DAPI對細(xì)胞核染色，結(jié)合深度學(xué)習(xí)方法推斷完整的細(xì)胞邊界
圖4-2：利用DAPI對細(xì)胞核染色，結(jié)合深度學(xué)習(xí)方法推斷完整的細(xì)胞邊界
圖5：將轉(zhuǎn)錄本分配給細(xì)胞
圖6-1：實現(xiàn)單細(xì)胞/亞細(xì)胞分辨率的空間轉(zhuǎn)錄組分析，綠點-EPCAM , 藍(lán)點-KLRD1 ，粉紅點-LILRB2
圖6-2：實現(xiàn)單細(xì)胞/亞細(xì)胞分辨率的空間轉(zhuǎn)錄組分析，綠點-EPCAM轉(zhuǎn)錄本
Xenium 具備簡單快速的工作流程
蘭衛(wèi)醫(yī)學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
與空間組學(xué)技術(shù)平臺
目前，蘭衛(wèi)醫(yī)學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序與空間組學(xué)三大平臺已承接多個三級醫(yī)院臨床與科研專家的項目，服務(wù)涉及北京、上海、廣東和江西等多個區(qū)域。蘭衛(wèi)醫(yī)學(xué)將持續(xù)聯(lián)合腫瘤專家、分子病理專家、生信專家/團隊和廠商專家，凝心聚力為客戶提供高質(zhì)量、高效率和可信賴的科研服務(wù)。
Xenium單細(xì)胞分辨率
賦能腫瘤空間組學(xué)研究
上海蘭衛(wèi)醫(yī)學(xué)檢驗所股份有限公司（以下簡稱“蘭衛(wèi)醫(yī)學(xué)”）秉承科研創(chuàng)新和勇于爭先的精神，與10x Genomics公司合作建立了高水平示范實驗室，配置了先進(jìn)的科研設(shè)備，為臨床科研提供單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序、空間轉(zhuǎn)錄組測序（Visium平臺）和基于原位雜交技術(shù)的空間轉(zhuǎn)錄組（Xenium平臺）檢測服務(wù)。
2024年1月16日，Xenium技術(shù)平臺第一批實驗樣本檢測數(shù)據(jù)正式下機，質(zhì)控完全合格，在上海率先高質(zhì)量高效率完成交付檢測和數(shù)據(jù)分析。該項目基于研究者對“腫瘤-分子病理-單細(xì)胞/亞細(xì)胞分辨率空間組學(xué)”層層遞進(jìn)的研究構(gòu)思，確定各種類型細(xì)胞的空間定位、比例和分布特征，逐步將target bio-marker定位在單細(xì)胞，為佐證研究者的idea提供了高水準(zhǔn)、信息化和可視化的結(jié)果與證據(jù)。
圖1：腫瘤病理標(biāo)注
圖2：Xenium數(shù)據(jù)概覽
圖3：Xenium將光學(xué)特征解碼為轉(zhuǎn)錄本表達(dá)，采集并形成圖像
圖4-1：利用DAPI對細(xì)胞核染色，結(jié)合深度學(xué)習(xí)方法推斷完整的細(xì)胞邊界
圖4-2：利用DAPI對細(xì)胞核染色，結(jié)合深度學(xué)習(xí)方法推斷完整的細(xì)胞邊界
圖5：將轉(zhuǎn)錄本分配給細(xì)胞
圖6-1：實現(xiàn)單細(xì)胞/亞細(xì)胞分辨率的空間轉(zhuǎn)錄組分析，綠點-EPCAM , 藍(lán)點-KLRD1 ，粉紅點-LILRB2
圖6-2：實現(xiàn)單細(xì)胞/亞細(xì)胞分辨率的空間轉(zhuǎn)錄組分析，綠點-EPCAM轉(zhuǎn)錄本
Xenium 具備簡單快速的工作流程
蘭衛(wèi)醫(yī)學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
與空間組學(xué)技術(shù)平臺
目前，蘭衛(wèi)醫(yī)學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序與空間組學(xué)三大平臺已承接多個三級醫(yī)院臨床與科研專家的項目，服務(wù)涉及北京、上海、廣東和江西等多個區(qū)域。蘭衛(wèi)醫(yī)學(xué)將持續(xù)聯(lián)合腫瘤專家、分子病理專家、生信專家/團隊和廠商專家，凝心聚力為客戶提供高質(zhì)量、高效率和可信賴的科研服務(wù)。
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